studentvHall

Kortom met BLAST kun je dus een stuk "genetische code" oftewel sequentie laten vergelijken met een database waarin zeer veel organismen staan. Hij vergelijkt de sequentie met bijv het Human genome(ons DNA) en als daar een "gelijke treft" een stuk dat overeen komt dan geeft het een hit. Bij de BLAST die ik heb gedaan komt alleen C sativa uit dus kan je aannemen dat alleen de C sativa deze specifieke sequentie bevat waardoor je hem dus kan onderscheiden van andere organismen. Hoop dat het nu wat duidelijker is Nee hierbij heb ik specifiek gekozen voor het THC gedeelte omdat deze uniek is bij de C Sative waardoor je hem dus kunt onderscheiden van andere organismen. Ik heb een deel van de sequentie van THC(1824 basenparen) genomen namelijk 533 basenparen waarvoor ik bijpassende primers(is een klein stukje DNA of RNA dat gebruikt wordt als startpunt van de PCR (polymerase chain reaction) hebt gemaakt.

Snowy bedankt (Y) Het is gelukt om primers te maken voor C sativa met vector NTI zonder hairpins etc etc. Ook is er mee geBLAST en hier kwamen positieve resultaten uit, namelijk 100% match met C sativa en geen enkel ander organisme. Primers zijn besteld dus nu wachten tot ze geleverd worden en dan PCR'en. Greets

Met de sequentie bedoel ik de volgorde van nucleotiden in een DNA- of RNA-molecuul of de volgorde van aminozuren in een eiwit.

Google is al gebruikt voor de zoekactie en de zoek knop op het forum ook.

Hallo, Wij zijn 3 studenten aan het van Hall Larenstein en zijn op zoek naar de seqeuntie van de Cannabis Sativa. Heeft iemand enig idee waar we zouden kunnen beginnen met zoeken(bijv NCBI, Pubmed etc.) Bij voorbaat dank